2018年12月20日,细胞生物学著名期刊The Journal of Cell Biology以Article形式在线发表了云南大学杨崇林实验室和中科院遗传发育所郭伟翔实验室合作的研究论文“The lysine catabolite saccharopine impairs development by disrupting mitochondrial homeostasis”(https://doi.org/10.1083/jcb.201807204)。该研究发现赖氨酸代谢产物酵母氨酸累积破坏线粒体稳态并影响发育,从而阐明了人类高赖氨酸血症发病机理,并进一步治疗提供了重要依据。
线粒体是细胞内氨基酸降解的重要场所,然而人们对氨基酸代谢异常对线粒体的影响却所知甚少。我们的研究表明,线粒体中酵母氨酸的正确降解对于线粒体稳态和动物正常发育是必要的。我们以秀丽线虫为模式,筛选到两个影响线粒体动态的突变体,yq170和yq211。突变体表皮细胞内的线粒体异常增大(图1)。
aass-1基因的两个功能缺失突变体yq170和yq211中表皮细胞内的线粒体异常增大。云大新闻中心供图
进一步的研究发现,两个突变体影响的是同一个基因,该基因编码的蛋白质与人类α-氨基半醛合酶(α-aminoadipic semialdehyde synthase, AASS)同源,所以我们将该基因命名为aass-1。AASS是赖氨酸代谢通路中的双功能酶,N端是赖氨酸-酮戊二酸还原酶 (LKR )结构域,C端是酵母氨酸脱氢酶 (SDH )结构域。yq170和yq211两个突变体中aass-1基因发生了功能缺失突变,而且突变位点都在C端的酵母氨酸脱氢酶(SDH)结构域。
进一步的研究表明,在aass-1突变体中,线粒体中的赖氨酸代谢产物酵母氨酸产生累积,从而破坏了线粒体的动态和功能,最终导致线虫生长受阻。在小鼠模型中,线粒体内酵母氨酸氧化缺陷会造成肝脏内线粒体的损伤,导致小鼠生长迟缓和过早死亡。
此外,我们还发现,抑制线粒体内酵母氨酸的前体—赖氨酸和α-酮戊二酸的产生,可以阻止SDH突变导致的酵母氨酸的累积和线粒体损伤。我们的研究证明了赖氨酸的正常代谢对于线粒体稳态的维持以及动物的发育是必须的(图2)。人类II型高赖氨酸血症(酵母氨酸血症)是一种严重影响人类发育的氨基酸代谢缺陷症,本研究揭示了酵母氨酸血症的发病机理,并为其治疗提供了重要依据。
赖氨酸代谢相关通路以及酵母氨酸累积造成线粒体损伤的机制示意图。云大新闻中心供图
杨崇林教授和郭伟翔研究员为该论文的共同通讯作者。杨崇林实验室博士生周骏翔为该论文的第一作者。杨崇林实验室的王鑫老师提供了电镜分析,郭伟翔实验室的王敏老师和博士后郭野参与了小鼠部分的工作。中科院遗传发育所的王国栋研究组在代谢组学分析方面、钱文锋研究组在生物信息方面给予极大帮助。该研究由科技部国家重点研发计划(2017YFA0503403,云南大学为课题依托单位)、国家自然科学基金委重点项目(31730053,云南大学为课题依托单位)等以及中科院项目资助。(云南大学新闻中心供稿)